Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms