Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms