Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CYBBP04839 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms