Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms