Protein–RNA interactions for Protein: O43543

XRCC2, DNA repair protein XRCC2, humanhuman

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC2O43543 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XRCC2O43543 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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