Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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MSI1O43347 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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MSI1O43347 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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MSI1O43347 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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MSI1O43347 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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