Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHGDHO43175 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms