Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms