Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms