Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms