Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms