Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms