Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFG3L2Q9Y4W6 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms