Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTC7AQ9ULT0 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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