Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms