Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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RABGEF1Q9UJ41 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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RABGEF1Q9UJ41 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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RABGEF1Q9UJ41 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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RABGEF1Q9UJ41 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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RABGEF1Q9UJ41 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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RABGEF1Q9UJ41 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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RABGEF1Q9UJ41 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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RABGEF1Q9UJ41 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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RABGEF1Q9UJ41 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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RABGEF1Q9UJ41 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
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