Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms