Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms