Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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