Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms