Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
USP35Q9P2H5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
USP35Q9P2H5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
USP35Q9P2H5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
USP35Q9P2H5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
USP35Q9P2H5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP35Q9P2H5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP35Q9P2H5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP35Q9P2H5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP35Q9P2H5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP35Q9P2H5 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP35Q9P2H5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
USP35Q9P2H5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms