Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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CNTN3Q9P232 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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CNTN3Q9P232 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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CNTN3Q9P232 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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CNTN3Q9P232 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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