Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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SH3BP4Q9P0V3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SH3BP4Q9P0V3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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