Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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MIS18AQ9NYP9 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
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MIS18AQ9NYP9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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MIS18AQ9NYP9 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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MIS18AQ9NYP9 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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MIS18AQ9NYP9 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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MIS18AQ9NYP9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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MIS18AQ9NYP9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MIS18AQ9NYP9 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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