Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms