Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms