Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms