Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms