Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms