Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CNPPD1Q9BV87 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CNPPD1Q9BV87 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CNPPD1Q9BV87 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CNPPD1Q9BV87 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CNPPD1Q9BV87 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CNPPD1Q9BV87 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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