Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDCA3Q99618 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms