Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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