Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms