Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRN2Q92932 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PTPRN2Q92932 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRN2Q92932 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRN2Q92932 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PTPRN2Q92932 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PTPRN2Q92932 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRN2Q92932 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PTPRN2Q92932 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRN2Q92932 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRN2Q92932 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PTPRN2Q92932 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRN2Q92932 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PTPRN2Q92932 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRN2Q92932 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRN2Q92932 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PTPRN2Q92932 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRN2Q92932 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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PTPRN2Q92932 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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