Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EDAQ92838 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EDAQ92838 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EDAQ92838 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EDAQ92838 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms