Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TTC9Q92623 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms