Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms