Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms