Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTT0

CLEC4C, C-type lectin domain family 4 member C, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4CQ8WTT0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLEC4CQ8WTT0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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