Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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