Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms