Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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CLIP4Q8N3C7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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CLIP4Q8N3C7 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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CLIP4Q8N3C7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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CLIP4Q8N3C7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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