Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms