Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms