Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms