Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms