Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms