Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms