Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms