Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms